公司发放的两笔工资在个人所得税上有记录，该

应联系公司核实工资发放情况，并查询个税记录。依据《中华人民共和国个人所得税法》，工资需缴个税，若公司漏发需及时补发，否则将影响你的合法权益及个税缴纳准确性，可能导致税务问题。
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常见处理方式为与公司沟通、查询银行流水、咨询税务部门。首先应与公司财务部门核实工资发放详情，若无法解决则查询银行交易记录作为证据，最后可咨询税务部门了解个税处理办法，根据具体情况选择最佳处理方式。
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联系公司处理。操作：1.与公司财务或人事沟通，了解工资发放详情，要求提供发放记录；2.核对银行流水，确认实际收款情况；3.如公司确实漏发，要求补发并说明原因；4.咨询税务部门，确保个税缴纳无误。若公司不予配合，可考虑法律途径维权。